为了做好慢病项目管理，越秀区与三甲医院合作开展各项癌症筛查。2010年，在越秀区开展癌症结直肠癌早诊早治工作，直至今年已经开展了第八期，2015－2018年起连续3年被国家评为“全国结直肠癌早诊早治优秀项目点”称号。截止2018年8月，共完成7863例居民的肠镜筛查，其中阳性病变数2531例，阳性率38.13％。

2017年，越秀区与中山大学肿瘤防治中心合作在全区的14条行政街开展国家城市癌症筛查项目，截止2018年8月，共完成2200名居民的临床筛查。2017年，与广州医科大学附属第一医院合作在我区的北京街、人民街、光塔街和珠光街开展肺癌筛查项目，截止2018年6月，共完成2316例居民的临床筛查，发现确诊癌症32人。

通过农村癌症、城市癌症和肺癌三个项目的筛查，越秀区为近万名居民提供了免费筛查，为3000多名阳性居民提供了早发现、早诊断和早治疗，降低了这些居民的家庭医疗负担，提高居民的生活质量和幸福感。

同时还开展各项眼科筛查项目。2018年，越秀区疾控中心与中山大学眼科中心合作在白云街、珠光街和东山街中开展“白内障和青少年近视”筛查，为居民提供免费的智能白内障和青少年近视筛查。截止至9月30日，共完成筛查2478人，检出白内障（含疑似）病人126人，眼底异常76人，建议转诊22人。青少年近视筛查187人，近视51人，建议转诊51人。2018年，与中山大学眼科中心合作在18个社卫中心开展“糖尿病视网膜病变”筛查，为糖尿病居民提供精确的诊断和治疗方案。截止9月30日，完成1121例糖尿病居民的临床筛查工作，发现双眼任意一眼发生病变234人，转介11人，有效提早介入治疗疾病。